Identificação de novas espécies de Streptomyces associadas à sarna da batata

Abstract

A sarna da batata é uma doença de ocorrência generalizada nas regiões produtoras do Brasil, tornando-se um fator limitante no cultivo dessa cultura. Essa doença afeta a qualidade da batata devido às lesões na superfície do tubérculo, que diminuem seu valor comercial ou impedem a sua comercialização. Diferentes espécies do gênero Streptomyces são responsáveis por essa doença e o levantamento das espécies patogênicas presentes no país é um fator primordial para a realização de medidas de manejo. O presente estudo teve por objetivo caracterizar e identificar 15 linhagens de Streptomyces sp. associadas à sarna da batata divididas em três grupos genéticos (G6, G9 e G16) por meio de abordagem polifásica envolvendo cinco parâmetros de caracterização: morfológico, bioquímico, fisiológico, patogênico e molecular. A caracterização morfológica demonstrou alta diversidade de coloração de esporos e de colônias das espécies avaliadas, assim como variação de crescimento em diferentes meios de cultivo. As características bioquímicas evidenciaram diferenças entre as linhagens avaliadas no estudo e as linhagens Tipo de Streptomyces associadas à doença. Os dados das avaliações fisiológicas (pH, salinidade e temperatura) permitiram classificá-las em padrões de tolerância. Todas as 15 linhagens se mostraram patogênicas em sementes de rabanete e discos de batata. As análises in silico de PCR-RFLP do gene atpD juntamente com as análises filogenéticas do gene 16S RNAr e MLSA revelaram a ocorrência de nove novas espécies de Streptomyces associadas à sarna da batata no Brasil. Dentre essas, duas linhagens do G6 tiveram seus genomas sequenciados e as avaliações de DDH e ANI confirmaram os dados da ocorrência de novas espécies. Elas foram denominadas Streptomyces hilarionis (IBSBF 2807T) e Streptomyces hayashii (IBSBF 2953T ).